盐湖城——犹他大学亨茨曼癌症研究所（HCI）的研究人员已经开发出一种新颖而强大的技术来识别人类RNA中一组称为RNA胞嘧啶甲基转移酶（RMTs）的酶的靶标. 他们将他们的技术应用于一个特定的RMT, NSUN2, 哪一种与人类智力迟钝和癌症有关, 发现并验证了许多以前未知的RMT目标——这表明了该技术的强大. 研究结果发表在该杂志的网络版上 自然生物技术 4月21日.
“尽管人们已经知道rmt很多年了, 实际上，大发娱乐对人类体内的大多数这些酶一无所知,布拉德利R说。. 该研究的合著者兼HCI基础科学高级主任Cairns说. “这项新技术现在将允许非常快速地识别每个人类RMT的直接靶rna, 大发娱乐对开展这项工作感到兴奋."
在所有活细胞中, RNA是DNA传递遗传信息的关键中间体——RNA由DNA合成，然后用来编码一种叫做酶的蛋白质，这种蛋白质控制细胞功能. 一个叫做胞嘧啶甲基化的过程将甲基分子附着在DNA和RNA分子中的胞嘧啶碱基上. rmt作为催化剂，允许RNA分子中特定位置的甲基化. 甲基化可以调节细胞内遗传信息（从RNA到蛋白质生产）的流动, 它可以改变RNA与蛋白质相互作用的方式.
这项工作涉及一种新的浓缩方法, 它使用一种特殊的“化学交联剂”将RMT物理地连接到它试图甲基化的RNA上, 瓦希德·霍达米说, 该研究的合著者，凯恩斯实验室的成员. “大发娱乐的新技术利用了这种酶的机制. 大发娱乐用的药物/交联剂看起来像胞嘧啶, 所以它取代了RNA中的胞嘧啶. RMT试图将这种药物甲基化——认为它是一个正常的靶胞嘧啶——但却与RNA交联, 确定预期甲基化的精确位置. 因为大发娱乐基于反应的方法要求酶既结合RNA又进行甲基化, 它大大增加了大发娱乐对真正阳性的识别,霍达米说.
“这项技术为大发娱乐大发娱乐提供了200倍的富集, 当两倍富集在过去被认为是一个伟大的结果,霍达米说. “事实上，对于某些类型的RNA，富集量超过700倍."
富集过程后, 高通量基因测序用于分析获得的RNA样品.
“大发娱乐的富集结果本身就非常棒, 但在测序过程中，大发娱乐有了另一个重要发现,霍达米说. “大发娱乐在测序后发现了这一点, 修饰RNA中的目标胞嘧啶反而作为替代分子出现, 鸟嘌呤核苷, 超过50%的时间. 测序后, 你可以寻找这些胞嘧啶到鸟苷的转化，并知道你有精确的目标-在一个单一的实验中."
据霍达米说, 在人类中已知有10种胞嘧啶rmt, 其中只有两个被部分描述. “其他8种都没有在实验室进行过研究,他解释道, 尽管其中一些已被证明与癌症有关, 不孕不育, 以及人类特殊的遗传疾病.
“这些疾病一直令人困惑，因为以前大发娱乐没有分析RNA的工具. 现在大发娱乐有了漂亮的工具。.
凯恩斯是霍华德休斯医学研究所的研究员，也是犹他大学肿瘤科学系的教授. 他还担任Jon and Karen Huntsman癌症研究总统教授. Khoddami是HCI凯恩斯实验室的博士候选人.
这项工作得到了霍华德休斯医学研究所的支持, 塞缪尔·韦克斯曼基金会, 亨茨曼癌症基金会, NCI CA24014.